2006 年美国的亚马逊公司推出了云计算，申元庆不曾想到此后自己的人生与这项技术有着千丝万缕的关系。
2009 年微软开始加大云计算战略投入，时任微软首席执行官史蒂夫·鲍尔默提出“一切尽在云端”，不再浪费时间去做企业内部的操作系统、数据库等业务。和当时大部分的微软人一样，申元庆也有过迷茫，当时微软90%的收入来源于操作系统、服务器、数据库等，而在云计算方面还处于探索阶段并未被验证成功。微软的这个举措更像一场赌博。申元庆清晰地记得，史蒂夫·鲍尔默告诉所有人：“赌输了也要赌。”史蒂夫·鲍尔默坚信，未来云计算将改变互联网的发展。
申元庆形容自己是“对一切抱有强烈好奇心的人”。凭借着这份好奇和执着到近乎偏执的态度，申元庆将更多的精力投入到云计算之中。 2012 年，申元庆出任微软中国云计算与企业事业部负责人，全面负责微软Azure在中国的落地生根，带领中国团队制定基于Microsoft Azure的云服务技术开发、服务管理、运营维护、本地云生态建设及客户体验，领导了微软Azure在中国市场的转型和成功，使Azure成为全球三大云服务厂商中最早在中国有落地产品运营的厂商。
他还率先将微软云加速器落地中国，并连续四年获投中集团颁发的中国最佳孵化器称号。这个项目被称为“创业企业加油站”，为初创企业提供办公空间、云计算资源、多方位培训与导师扶持、技术及运营指导、融资机会等多种资源。截至 2017 年 6 月，已累计为 170 家创业企业成功加速。这些企业总估值超过 566 亿元，有93%在加速期间获得了下一轮融资，其产品和服务在中国覆盖超过 200 万家企业客户和 5 亿个人用户。
申元庆带领着微软的云计算在中国披荆斩棘，快速培养、占领市场，外媒评价他为中国云计算领域的领军人物。这是属于申元庆的人生上半场，成功的职业经理人的生涯为他带来了沉淀与积累。接下来，他为自己打上了“事业合伙人”的标签，前方有更有意义的事等待着他去完成。
私心
乔布斯曾问可口可乐前总裁斯卡利：“在剩下的人生中，你是想继续卖糖水还是想和我一起改变这个世界?”改变世界、创造不同从来不是某一家公司的壮志雄心，它是每一个科技推动者的使命。云计算正为各行业、领域带去革命性的改变，作为这一切的见证者与推动者，申元庆觉得自己很幸运，在满怀激情的同时，也体会到强烈的使命感。
申元庆并不回避自己的“小野心”，甚至将此称为自己的“私心”，他希望在不久的将来能够帮助京东云成为国内云计算行业的领军者。对申元庆而言，这不是荣耀，而是更多的责任。
